《《我的女班主任》2 》故事讲述了太初元年，正道玄帝与魔神迦叶决战于池屏，玄帝以沉重代价将魔神迦叶封印于池屏。为了防止魔神复活，玄帝用玲珑仙府，将魔神迦叶的魂石镇压在禁地之中。万年之后，玲珑仙府成了仙湖小学，新生章自然在学校里遇到种种让人费解的怪事和各种惊险经历，最终揭开了隐藏在学校深处的天机密令，并加入了战胜邪魔的战斗，最终章自然和他的伙伴们机智、勇敢的战胜了邪恶势力。仙湖小学恢复了往日的宁静。