《激萌秘密导航》继第一部电影的事件之后，萨扬来到了阿塔卡马沙漠，追寻着一个与她的任务有关的线索。她的任务是对抗Actaeon，这个跨国组织不仅使她的家庭悲惨凄凉，还破坏了智利各地的生态系统。