《格格导航黑科技破解版》故事取材自《西游记》第五十七回“真假孙悟空”，讲述孙悟空中了黄眉老怪的奸计，被关押至一座神秘洞穴之中，法力全失、金箍棒也被收缴。黄眉老怪在这神秘山洞中建立了难以撼动的强大军队，囚禁着各路妖怪，在得力战将牛魔王的帮助下，设立了生死场，让小妖在此拼杀，死了的便夺走其灵力，将灵力灌入泥巴造出了六耳猕猴，试图取代真正的孙悟空，洞穴成了残酷的杀戮战场。六耳猕猴假扮花果山猴子，与孙悟空朝夕相处。孙悟空在洞穴中受尽欺压，曾一度陷入绝望，习惯单打独斗的他被迫与众妖联手自救，在一次次的失败中逐渐悟出“大圣”二字的真正含义。最终，被取走石心的孙悟空涅槃重生，与黄眉老怪决一死战，并率领大家逃离山洞。