《仙女快乐棒12厘米》小店店员敏郎和小女孩早智住在石川县的乡下。一天在小镇上发生了一场神秘的谋杀，随后发现这其实仅仅是对敏郎之后遭遇的警示。原来敏郎曾效忠于一个神秘的组织，然而他却亲手摧毁了这个组织，仅留下长官幽灵一个活口。幽灵于是带着杀手们前来复仇，决心处决这个叛徒。敏郎也为了他所爱的人们而与幽灵决一生死。