《秘密入口3秒自动进入》瑞克（迈克尔·杜迪考夫 饰）是个顶尖生化专家，曾在波斯湾战争中立下大功，一晚实验室中大量致命毒气被盗，就在千均万发之际，瑞克凭着他过人的胆识及沉着的智慧，才不致造成更大的灾难。事件过后，瑞克被要求协助案子调查，而他的妻子则因公务需要搭上副总统的访问专机，没想到另有一场危机正蓄势待发。五个由卡洛斯领导的恐布份子，不仅偷了生化武器外，还劫了副总统的座机。由于瑞克的妻子也在飞机上，于是瑞克决定与一批救难人员进入卡洛斯所劫持的飞机，但救援人手并没有顺利潜入飞机，只留下瑞克孤军奋斗。卡洛斯不但狮子大开口，还计划毁掉美国华府，而这才是他真正的目的。在海拔三万英尺的高空中，瑞克必须奋力再度阻止危机的发生。好不容易才疏散了副总统和官员，但卡洛斯还是发现瑞克的妻子在机上，并威胁瑞克就范，还疯狂地控制飞机。